壓差控制是凈化空調系統中一個非常重要的環節。潔凈實驗室高效安全的手術室空氣凈化系統，保證手術室的無菌環境，可以滿足器官移植、心臟、血管、人工關節置換等手術所需的高度無菌環境。采用高效低毒消毒劑，以及合理使用，是保障一般手術室無菌環境的有力措施。潔凈車間必須保持一定的正壓，使未凈化空氣不能進入凈化區以保證潔凈水平；通過對各凈化區域的壓差控制，達到凈化區的作用，在GMP中要求不同凈化級別區域的壓差控制不小于5Pa。在生物安全潔凈室中，壓差控制是保證安全防護屏障的關鍵指標。“生物安全實驗室建筑技術規范”指出，實驗室的負壓梯度必須穩定可靠地控制。因此，對于空調系統的凈化來說，壓差控制是非常重要的。
為了確保潔凈室暫時損壞或空氣平衡暫時受損，氣流可以從空氣潔凈度高的區域流到空氣潔凈度低的區域，因此潔凈室的清潔度不會受到干擾。污染的空氣，所以潔凈室必須保持一定的壓差。
潔凈室壓差的控制方法是根據建立壓差的原則，對其影響因素進行有效控制或調整，以保持潔凈室壓差的穩定性。潔凈室壓差控制方法分為人工干預調節和自動控制兩種。
人為的干預措施，以調整清潔房間的壓力差
主要內容如下：(1)定期檢查和維護清潔廠房圍護結構的氣密性，盡可能減少漏風；定期清洗或更換過濾器，以保證系統正常的阻力。
（2）回風口控制：這是一種簡單有效的方法。通過改變風口上的百葉窗格柵或空氣阻尼層的阻力來調節回風量，實現差壓控制的目的。由于百葉窗的體積不大，會改變氣流的方向，所以這種方法只能粗調。
(3)馀壓閥控制：當潔凈室有足夠的殘余風量時，可調整馀壓閥上的平衡壓力塊，改變其開度，實現壓差控制。
（四）調整回閥或者排氣閥。
（5）調整新風閥或供氣閥門。
自動控制潔凈室壓差法
（1）傳感器控制：通過相應的傳感器檢測室內的壓差或送、排氣管路中的壓力或氣流，然后調節送、排氣量，通過管路中的電動閥或風機的速度來實現。（變頻器控制風扇）。這是一種更精確的自動控制，目前使用較多。
（二）微機控制系統：包括直接數字控制系統和分布式控制系統。它們是基于微處理器和實現自動監測。在滿足系統安全運行和各項指標的前提下，更好地保證過程要求，最大限度地節約能源。控制。微機控制系統是將傳感器或發射機的輸出信號直接輸入微機。經微型計算機處理后，直接驅動執行機構（電閉閥等），達到清潔室的壓差、溫度和濕度、清潔度等檢測、控制和管理指標。
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